प्रोकेरियोट्स और यूकेरियट्स के बीच अंतर यूकेरियोट्स में
यूकेरियोट्स को 'सच्चा न्यूक्लियस' कहा जाता है क्योंकि इसमें झिल्ली-बद्ध नाभिक होते हैं और इसमें अन्य ऑर्गेनल्स जैसे ल्यसोसोम, गोलगी कॉम्प्लेक्स, एंडोप्लाज्मिक रेटिक्यूलम, मिटोकोंड्रिया और क्लोरोप्लास्ट्स होते हैं, जबकि प्रोक्रियोयोट्स में परमाणु झिल्ली या अन्य झिल्ली को संलग्न ऑर्गेनल्स नहीं होता है ।
प्रोकोरियट्स में फ्लैगेलम दो प्रोटीन बिल्डिंग ब्लॉकों से बना है; और सेल की दीवार रासायनिक रूप से जटिल होती है और पेप्टाइडोग्लाइकेन (अमीनो एसिड और चीनी का एक बड़ा बहुलक) का बना होता है, जबकि यूकेरियोट्स 'फ्लगारेलम कई माइक्रोट्यूब्यूल्स के साथ अधिक जटिल होता है और जब सेल की दीवारें मौजूद होती हैं तो वे रासायनिक रूप से सरल होते हैं।
प्रोकैरियोट्स में, कोशिका विभाजन द्विआधारी विखंडन के माध्यम से होता है और कोई अर्धसूत्रीविभाजन होता है, लेकिन डीएनए के टुकड़े के स्थानांतरण केवल संयुग्मन के माध्यम से होता है यूकेरियोट्स में सेल डिविजन मिटिसोस के माध्यम से होता है और अर्धसूत्रीविभाजन के माध्यम से यौन प्रजनन होता है
प्रॉकार्योट्स में, प्लाज्मा झिल्ली में कार्बोहाइड्रेट या स्टेरोल शामिल नहीं है। साइटोप्लाज्म में साइटोस्केट्टन या साइटोप्लास्मिक स्ट्रीमिंग नहीं है रिबोसोम आकार में छोटा (70 एस) हैं और एकल परिपत्र गुणसूत्र के साथ मौजूद है जो हिस्टोन को शामिल नहीं करता है।