माइक्रोएरे और आरएनए अनुक्रमण के बीच अंतर | माइक्रोएरे बनाम आरएनए अनुक्रमण

मुख्य अंतर - माइक्रोएरे बनाम आरएनए अनुक्रमण

ट्रांसक्रिप्टम एमआरएनए, आरआरएनए, टीआरएनए, अपमानित आरएनए और एननेग्रेटेड आरएनए सहित सेल में मौजूद आरएनए की पूरी सामग्री का प्रतिनिधित्व करता है। सेलिंग अंतर्दृष्टि को समझने के लिए प्रोफाइलिंग ट्रान्सस्क्रिप्टम एक महत्वपूर्ण प्रक्रिया है। ट्रांस्क्रिप्टम प्रोफाइलिंग के लिए कई उन्नत विधियां हैं ट्रांस्क्रिप्टम का विश्लेषण करने के लिए विकसित माइक्रोएरे और आरएनए अनुक्रमण दो प्रकार की प्रौद्योगिकियां हैं। माइक्रोएरे और आरएनए अनुक्रमण के बीच मुख्य अंतर यह है कि माइक्रोएरे लक्ष्य सीडीएनए अनुक्रमों के साथ पूर्वनिर्धारित लेबल जांच की संकरण क्षमता पर आधारित है, जबकि आरएनए अनुक्रमण सीडीएनए की सीढ़ियों पर आधारित है, जैसे एनजीएस उन्नत अनुक्रमण तकनीकों द्वारा। अनुक्रमों के बारे में पूर्व ज्ञान के बिना माइक्रोएरे का प्रदर्शन किया जाता है और अनुक्रमों के पूर्व ज्ञान के बिना आरएनए अनुक्रमण का प्रदर्शन किया जाता है।

सामग्री

1। अवलोकन और महत्वपूर्ण अंतर

2 माइक्रोएरे

3 क्या है आरएनए अनुक्रमण 4 क्या है साइड तुलना द्वारा साइड - माइक्रोएरे बनाम आरएनए अनुक्रमण

5 सारांश

माइक्रोएरे क्या है?

माइक्रोएरे वैज्ञानिकों द्वारा प्रतिलेखन प्रोफाइलिंग के लिए इस्तेमाल किया जाने वाला एक मजबूत, विश्वसनीय और उच्च थ्रूपुट विधि है। ट्रांसक्रिप्ट विश्लेषण के लिए यह सबसे लोकप्रिय दृष्टिकोण है यह एक कम लागत वाली विधि है, जो संकरण जांच पर निर्भर करती है।

तकनीक नमूना से एमआरएनए की निकासी और कुल आरएनए से सीडीएनए पुस्तकालय के निर्माण से शुरू होती है। फिर यह एक ठोस सतह (स्पॉट मैट्रिक्स) पर फ्लोरोसेंटली लेबल प्रीडसाइंड जांच के साथ मिलाया जाता है। पूरक अनुक्रम माइक्रोएरे में लेबल वाले जांच के साथ संकरित होते हैं। फिर माइक्रोएरे धुलाई और जांच की जाती है, और छवि मात्रा निर्धारित की जाती है। सापेक्ष अभिव्यक्ति प्रोफाइल प्राप्त करने के लिए इकट्ठे हुए डेटा का विश्लेषण किया जाना चाहिए।

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माइक्रोएरे जांच की तीव्रता को नमूना में प्रतिलिपियों की मात्रा के अनुपात में माना जाता है। हालांकि, तकनीक की सटीकता डिजाइन की जांच पर आधारित है, अनुक्रम के पूर्व ज्ञान और संकरण के लिए जांच का संबंध है। इसलिए माइक्रोएरे तकनीक में सीमाएं हैं। माइक्रोएरे तकनीक कम प्रचुर मात्रा में प्रतिलेखों के साथ नहीं की जा सकती यह isoforms अंतर करने में विफल रहता है और जेनेटिक वेरिएंट की पहचान करता है। चूंकि यह विधि जांच के संकरण पर निर्भर करती है, इसलिए संकरण से संबंधित कुछ समस्याएं जैसे पार-संकरण, गैर-विशिष्ट संकरण आदि।माइक्रोएरे तकनीक में होता है

चित्रा 01: माइक्रोएरे

आरएनए अनुक्रमण क्या है?

आरएनए बन्दूक अनुक्रमण (

आरएनए सैक) हाल ही में विकसित पूरे ट्रांस्क्रिप्टम अनुक्रमण तकनीक है यह ट्रांस्क्रिप्टम प्रोफाइलिंग का एक तेज़ और उच्च थ्रूपुट विधि है यह ट्रांस्क्रिप्टम की गहरी जांच में जीनों की अभिव्यक्ति और परिणाम को सीधे बताता है। आरएनए seq पूर्वनिर्धारित जांच या अनुक्रमों के पूर्व ज्ञान पर निर्भर नहीं करता है। इसलिए, आरएनए seq विधि में उच्च संवेदनशीलता और उपन्यास जीन और आनुवंशिक रूपों का पता लगाने की क्षमता है। आरएनए अनुक्रमण विधि कई चरणों के माध्यम से किया जाता है सेल के कुल आरएनए को पृथक और विखंडित होना चाहिए। फिर, रिवर्स ट्रांस्क्रिप्टेज़ का उपयोग करके, सीडीएनए पुस्तकालय तैयार होना चाहिए। प्रत्येक सीडीएनए स्ट्रैंड को एडेप्टर के साथ लगी होना चाहिए। तब ligated टुकड़े प्रवर्धित और शुद्ध किया जाना चाहिए अंत में एक एनजीएस विधि का उपयोग करते हुए, सीडीएनए की अनुक्रमण करना चाहिए। चित्रा 02: आरएनए अनुक्रमण

माइक्रोएरे और आरएनए अनुक्रमण के बीच क्या अंतर है?

- तालिका से पहले अंतर आलेख ->

माइक्रोएरे बनाम आरएनए अनुक्रमण

माइक्रोएरे एक मजबूत, विश्वसनीय, उच्च थ्रूपूट विधि है

आरएनए अनुक्रमण एक सटीक और उच्च-थ्रूपुट विधि है।
लागत	यह एक कम लागत वाली विधि है
यह एक महंगी विधि है
नमूने की एक बड़ी संख्या का विश्लेषण	यह एक साथ बड़ी संख्या में नमूने का विश्लेषण करने की सुविधा प्रदान करता है
यह बड़ी संख्या में नमूने का विश्लेषण करने की सुविधा प्रदान करता है
डेटा विश्लेषण	डेटा विश्लेषण जटिल है
इस पद्धति में अधिक डेटा उत्पन्न होता है; इसलिए, प्रक्रिया अधिक जटिल है।
अनुक्रमों के पूर्व ज्ञान	यह विधि संकरण जांच पर आधारित है, इसलिए आवश्यक क्रम में अनुक्रमों का ज्ञान
यह विधि पूर्व अनुक्रम ज्ञान पर निर्भर नहीं करती है
संरचनात्मक विविधताएं और उपन्यास जीन	यह विधि संरचनात्मक रूपों और उपन्यास जीनों का पता नहीं लगा सकती
यह विधि संरचनात्मक रूपों जैसे जीन फ्यूसिंग, वैकल्पिक विभाजन, और उपन्यास जीन का पता लगा सकता है
संवेदनशीलता	यह isoforms की अभिव्यक्ति में मतभेदों का पता नहीं लगा सकता है, इसलिए इसमें सीमित संवेदनशीलता है
इसमें उच्च संवेदनशीलता है
परिणाम	यह केवल रिश्तेदार अभिव्यक्ति के स्तर में परिणाम कर सकते हैं यह जीन की अभिव्यक्ति का पूर्ण मात्रा का ठहराव नहीं देता है
यह निरपेक्ष और रिश्तेदार अभिव्यक्ति के स्तर देता है
डेटा रेनालिसिस	इसे फिर से विश्लेषण करने के लिए पुन: चलाया जाना चाहिए।
अनुक्रमण आंकड़ों का पुन: विश्लेषण किया जा सकता है
विशिष्ट कार्मिक और आधारभूत संरचना के लिए आवश्यक	माइक्रोएरे के लिए विशिष्ट बुनियादी ढांचे और कर्मियों की आवश्यकता नहीं है।
आरएनए अनुक्रमण द्वारा आवश्यक विशिष्ट आधारभूत संरचना और कर्मियों
तकनीकी समस्याएं	माइक्रोएरे तकनीक में तकनीकी मुद्दों जैसे क्रॉस-हाइब्रिडिज़ेशन, गैर-विशिष्ट संकरण, व्यक्तिगत जांच की सीमित पहचान दर आदि शामिल हैं।
आरएनए सीक तकनीक तकनीकी मुद्दों से बचता है जैसे कि क्रॉस-हाइब्रिडिज़ेशन, गैर-विशिष्ट संकरण, सीमित व्यक्तिगत जांचों का पता लगाने की दर आदि। जीवविवाह यह एक पक्षपाती पद्धति है क्योंकि यह संकरण पर निर्भर करता है।
पूर्वाग्रह माइक्रोएरे की तुलना में कम है	सारांश - माइक्रोएरे बनाम आरएनए अनुक्रमण
माइक्रोएरे और आरएनए अनुक्रमण पद्धतियों ट्रांसप्टोमाइट प्रोफाइलिंग के लिए विकसित उच्च थ्रूपुट प्लेटफॉर्म हैं दोनों तरीकों से परिणाम उत्पन्न होते हैं जो जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल से अत्यधिक सहसंबद्ध होते हैं हालांकि, जीएन अभिव्यक्ति विश्लेषण के लिए माइक्रोएरे पर आरएनए अनुक्रमण का लाभ है। माइक्रोएरे की तुलना में कम प्रचलित प्रतिलेखों का पता लगाने के लिए आरएनए अनुक्रमण एक अधिक संवेदनशील तरीका है। आरएनए अनुक्रमण भी isoforms और जीन वेरिएंट की पहचान के बीच भेदभाव को सक्षम बनाता है। हालांकि, माइक्रोएरे सबसे अधिक शोधकर्ताओं का आम विकल्प है क्योंकि आरएनए अनुक्रमण एक नई और महंगी तकनीक है, जो डेटा भंडारण चुनौतियों और जटिल डेटा विश्लेषण के साथ है।
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चित्र सौजन्य:

1 "जर्नल। pcbi। 1004393. g002 "मालाची ग्रिफ़िथ, जेसन आर। वाकर, निकोलस सी। स्पाइस, बेंजामिन जे। ऐन्सकॉफ़, ओबी एल। ग्रिफ़िथ - (सीसी द्वारा 2. 5) कॉमन्स विकिमीडिया के माध्यम से

2 "माइक्रोएरे" बिल ब्रानसन (फोटोग्राफर) द्वारा - राष्ट्रीय कैंसर संस्थान (सार्वजनिक डोमेन) कॉमन्स के माध्यम से विकिमीडिया