विस्फोट और फास्टा के बीच का अंतर
फास्टा बनाम विस्फोट
विस्फोट और फास्टा दो सॉफ्टवेयर हैं जो डीएनए, एमिनो के जैविक दृश्यों की तुलना करने के लिए उपयोग किए जाते हैं एसिड, प्रोटीन और विभिन्न प्रजातियों के न्यूक्लियोटाइड्स और समानताएं देखें। इन एल्गोरिदम को गति को ध्यान में रखते हुए लिखा गया था क्योंकि चूंकि 1 9 80 के दशक के मध्य में डीएनए वैज्ञानिकों द्वारा प्रयोगशाला में पृथक होने के बाद दृश्यों का डाटा बैंक बढ़ गया था, वहां उच्च गति पर आगे के शोध के समान जीन की तुलना करने और उन्हें खोजने की आवश्यकता को बढ़ाया गया था। ब्लास्ट मूल स्थानीय संरेखण खोज उपकरण के लिए एक संक्षिप्त शब्द है और दो दृश्यों की तुलना में स्थानीयकृत दृष्टिकोण का उपयोग करता है। फास्टा एक फास्ट ए के रूप में जाना जाता है जो ए के लिए खड़ा है क्योंकि यह फार्मा ए के लिए डीएएनए अनुक्रमण और फास्ट पी प्रोटीन जैसे वर्णमाला के साथ काम करता है। ब्लास्ट और फास्टा दोनों ही किसी भी जीनोम डाटाबेस की तुलना में बहुत तेजी से हैं और इसलिए बहुत ही मुनाफे के साथ-साथ समय की बचत भी करते हैं।
ब्लास्ट
सबसे व्यापक रूप से इस्तेमाल किए जाने वाले बायोइनफॉर्मेटिक्स सॉफ़्टवेयर ब्लास्ट में से एक ने 1 99 0 में विकसित किया था और उसके बाद से यह एनसीबीआई साइट पर हर किसी के लिए उपलब्ध है। यह सॉफ़्टवेयर किसी भी एक के द्वारा पहुंचा जा सकता है और जिनके ज़रिये जरूरत पड़ने पर संशोधित किया जा सकता है। ब्लास्ट सॉफ्टवेयर है जिसमें तुलना की जाने वाली अनुक्रम के इनपुट डेटा फ़ास्टा प्रारूप में हैं और आउटपुट डेटा सादा पाठ, एचटीएमएल या एक्सएमएल में प्राप्त किया जा सकता है। विस्फोट दो अनुक्रमों के बीच स्थानीयकृत समानताओं के लिए खोज के सिद्धांत पर काम करता है और शॉर्ट इन शृंखला को इसी तरह की पड़ताल करता है जो पड़ोस समानता की खोज करता है। सॉफ्टवेयर समान स्थानीय क्षेत्रों की उच्च संख्या के लिए खोज करता है और एक थ्रेसहोल्ड मान तक पहुंचने के बाद परिणाम देता है। यह प्रक्रिया पहले के सॉफ़्टवेयर से अलग है जिसमें पूरे अनुक्रम की खोज की गई थी और तुलना की गई थी, जो बहुत समय लगा। ब्लास्ट डीएनए मानचित्रण जैसे कई उद्देश्यों के लिए उपयोग किया जाता है, जो कि विभिन्न प्रजातियों में दो समान जीनों की तुलना करते हैं, जो कि फ़िलेजिनेटिक पेड़ का निर्माण करते हैं।
-2 ->फास्टा फास्टा प्रोग्राम प्रोटीन दृश्यों की तुलना करने के लिए 1 9 85 में लिखा गया था लेकिन बाद में इसे डीएनए पर खोजों के लिए संशोधित किया गया। फास्टा सॉफ्टवेयर सांख्यिकीय रूप से दो दृश्यों के बीच समानता पाने के सिद्धांत का उपयोग करती है। यह सॉफ़्टवेयर स्थानीय अनुक्रम संरेखण विधि द्वारा दूसरे के साथ डीएनए या प्रोटीन का एक क्रम से मेल खाता है। यह समानता के लिए स्थानीय क्षेत्र की खोज करता है, न कि दो दृश्यों के बीच का सबसे अच्छा मैच। चूंकि यह सॉफ़्टवेयर कई बार समान समानता की तुलना करती है इसलिए यह एक बेमेल के साथ आ सकता है। अनुक्रम फास्टा में एक छोटा सा हिस्सा है जिसे कि-ट्यूपल्स कहा जाता है, जहां ट्यूपल 1 से 6 तक हो सकता है और अन्य अनुक्रमों के के-ट्यूप्ले के साथ मिलान हो जाता है और जब मिलान के थ्रेशोल्ड मान तक पहुंच जाता है, तो परिणाम के साथ यह आता है। यह एक ऐसा प्रोग्राम है जिसका इस्तेमाल पूरी तुलना के लिए बड़ी संख्या से मिलान अनुक्रम की संभावनाओं को संक्षिप्त करने के लिए किया जाता है क्योंकि यह बहुत तेजी से है
