एसआईबीआर ग्रीन और ताकमान के बीच अंतर | SYBR ग्रीन बनाम Taqman

मुख्य अंतर - एसआईबीआर ग्रीन बनाम ताकमान

एसआईबीआर ग्रीन और ताकमान वास्तविक समय पीसीआर की प्रवर्धन प्रक्रिया का पता लगाने या देखने के लिए नियोजित दो तरीके हैं। एसआईबीआर ग्रीन अंतरफलक न्यूक्लिक एसिड स्टीनिंग डाई पर आधारित एक विधि है, जबकि ताकमान hydrolysis जांच के आधार पर एक विधि है। दोनों तकनीकों को पीसीआर के दौरान प्रतिदीप्ति उत्पन्न करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो वास्तविक समय पीसीआर मशीन को "वास्तविक समय" में प्रतिक्रिया की निगरानी करने की अनुमति देता है। एसआईबीआर ग्रीन विधि एसआईबीआर हरे नामक एक फ्लोरोसेंट डाई का उपयोग करके किया जाता है और डबल फंसी डीएनए तैयार करने के लिए डाई बाइंडिंग द्वारा प्रवर्धन का पता लगाता है। Taqman दोहरे लेबल जांच का उपयोग किया जाता है और Taq पोलीमरेज़ द्वारा जांच की गिरावट और फ्लोरोफोरे के रिलीज द्वारा प्रवर्धन का पता लगाता है। यह एसआईबीआर ग्रीन और ताकमान के बीच महत्वपूर्ण अंतर है

सामग्री

1। अवलोकन और महत्वपूर्ण अंतर

2 एसआईआरआर ग्रीन

3 क्या है ताक़मान

4 क्या है साइड तुलना द्वारा साइड - एसआईबीआर ग्रीन बनाम ताकमान

5 सारांश

एसआईबीआर ग्रीन क्या है?

एसआईबीआर ग्रीन एक फ्लोरोसेंट डाई है जो कि न्यूक्लिक एसिड को दाग करने के लिए उपयोग किया जाता है, विशेषकर डबल फंसे हुए डीएनए आणविक जीवविज्ञान में। एसआईबीआर ग्रीन पद्धति का उपयोग वास्तविक समय पीसीआर के दौरान पीसीआर उत्पादों को मापने के लिए किया जाता है। डीएनए के साथ बांधने के बाद, परिणामस्वरूप डीएनए-डाई कॉम्प्लेक्स नीले प्रकाश को अवशोषित करता है और तीव्र हरे प्रकाश का उत्सर्जन करता है। यह डबल-फंसे डीएनए के साथ बाइंडिंग पर डाई अणु में होने वाली संरचनात्मक परिवर्तन के कारण होता है। जब पीसीआर अधिक से अधिक डीएनए बनाता है, तो डीएनए से अधिक डाई अणुओं को बाध्य किया जाता है, जिससे अधिक प्रतिदीप्ति पैदा होती है। इसलिए, प्रतिदीप्ति पीसीआर उत्पाद संचय के साथ बढ़ता है। इसलिए, पीसीआर उत्पाद की मात्रा मात्रात्मक रूप से SYBR ग्रीन प्रतिदीप्ति पहचान द्वारा मापा जा सकता है।

साइबोरेट्री और फ्लोरोसेंट माइक्रोस्कोपी में डीएनए लेबलिंग के लिए एसआईबीआर हरी डाई भी इस्तेमाल किया जा सकता है। एथिडियम ब्रोमाइड को सफलतापूर्वक एसआईबीआर ग्रीन द्वारा प्रतिस्थापित किया गया है क्योंकि एथिडियम ब्रोमाइड जेल वैद्युतकणसंचलन में डीएनए विज़ुअलाइजेशन के दौरान निपटान समस्याओं के साथ एक कैंसरजनक डाई है।

SYBR हरे रंग की विधि के फायदे और नुकसान हैं यह विधि बहुत संवेदनशील, सस्ती और उपयोग में आसान है। हालांकि, किसी भी डबल-फंसे डीएनए को बाँधने की अपनी क्षमता के कारण, गैर-विशिष्ट बाध्यकारी पीसीआर उत्पाद की मात्रा का भार बढ़ा सकता है।

चित्रा 01: एसआईबीआर ग्रीन तकनीक

ताकमान क्या है?

वास्तविक समय पीसीआर प्रक्रिया को मॉनिटर करने के लिए सैकबर ग्रीन का एक वैकल्पिक तरीका है Taqman। यह विधि नई किनारे के विस्तार के दौरान जांच को नीचा दिखाने के लिए और फ्लोरोफोरे के रिलीज के लिए Taq Polymerase एंजाइम की 5 '-3' एक्सोन्यूलेज गतिविधि पर निर्भर करता है।दोहरी लेबल वाली जांच इस पद्धति में उपयोग की जाती है और यह जांच के जल-विषाक्तता पर आधारित है। 5 'अंत में फ्लोरोसेंट रिपोर्टर अणु (फ्लोरोफोरे) और 3' अंत में एक बुझानेवाले अणु वाले डीएनए ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लेबलों पर जांच की जाती है। वे प्राइमर एनेल्स के विपरीत दिशा में एकल फंसे टेम्पलेट पर बाँध करने के लिए डिज़ाइन किए गए हैं। Taq पोलीमरेज़ प्राइमर के लिए न्यूक्लियोटाइड जोड़ता है और दोहरे लेबल वाले जांचों के लिए नए किनारे का विस्तार करता है। एक बार जब Taq पोलीमरेज़ जांच को पूरा करता है, Taq पोलीमरेज़ की एक्सोन्युकेलीज एक्शन सक्रिय करता है और जांच को कम कर देता है एक बार जब यह नई भूग्रस्त के संश्लेषण को पूरा कर लेता है, तो जांच में गिरावट पूरी हो जाती है और फ्लोरोफोरे को छोड़ दिया जाता है। फ्लोरोफोरे की रिहाई प्रतिदीप्ति उत्पन्न करती है फ्लोरोसेंट क्वीनर अणु कुशलतापूर्वक उत्सर्जित प्रकाश को बुझता है और पीसीआर उत्पाद की मात्रा का ठहराव के लिए उत्पादन बनाता है। फ्लोरोफोर्स की रिलीज और पीसीआर उत्पादों की मात्रा आनुपातिक है। इसलिए, मात्राकरण आसानी से ताक़मान विधि द्वारा किया जा सकता है।

चित्रा 02: ताक़मान विधि

ताक़मान विधि वास्तविक समय पीसीआर, जीन अभिव्यक्ति की मात्रा का ठहराव, आनुवंशिक बहुरूपता का पता लगाने, गुणसूत्र डीएनए विलोपन की मात्रा का ठहराव, बैक्टीरिया की पहचान, माइक्रोएरे विश्लेषण का सत्यापन, एसएनपी जीनोटाइपिंग आदि में प्रयोग किया जाता है। एसआईबीआर हरे और ताकमान के बीच अंतर क्या है?

- तालिका से पहले अंतर आलेख ->

SYBR हरा बनाम ताकमान

SYBR ग्रीन डीएनए बाध्यकारी डाई पर आधारित है।
Taqman हाइब्रिडिजेशन जांच और 5 'से 3' Taq पॉलिमरज़ की एक्सोन्यूलेज गतिविधि पर निर्भर करता है।	फ्लोरोसेंटली लेबल किए गए जांच
कोई फ्लोरोसेंटली लेबल जांच नहीं जरूरी है
दोहरे लेबल वाली जांच आवश्यक है	मल्टीप्लेक्स जीन विश्लेषण
मल्टीप्लेक्स जीन लक्ष्य के लिए इसका इस्तेमाल नहीं किया जा सकता।
इसका उपयोग मल्टीप्लेक्स जीन लक्ष्य के लिए किया जा सकता है।	लागत
यह कम खर्चीला है
यह अधिक महंगा है	विशिष्टता
यह कम विशिष्ट है और किसी भी डबल स्ट्रैंड डीएनए के साथ बांधता है
ये बहुत विशिष्ट हैं क्योंकि जांच में विशिष्ट प्रवर्धन उत्पादों का पता लगा है।	प्रभावशीलता
यह कम प्रभावी है
यह अत्यधिक प्रभावी है	आवेदन
यह वास्तविक समय पीसीआर, एगरोज जेल विज़ुअलाइज़ेशन, डीएनए लेबलिंग आदि में प्रयोग किया जाता है। यह वास्तविक समय पीसीआर, जीन की अभिव्यक्ति की मात्रा का ठहराव, आनुवंशिक बहुरूपताओं का पता लगाने आदि में प्रयोग किया जाता है।
सारांश - एसआईबीआर ग्रीन और ताकमान	ताकमान और एसईबीआर हरा वास्तविक समय पीसीआर (मात्रात्मक पीसीआर) में नियोजित दो तरीके हैं। दोनों तरीकों से पीसीआर उत्पाद की कुशलता को कुशलतापूर्वक सक्षम और प्रतिदीप्ति के उत्सर्जन पर भरोसा किया जा सकता है। Taqman विधि संचित डीएनए की पहचान के लिए दोहरे लेबल जांच का उपयोग करता है जबकि SYBR ग्रीन विधि एक फ्लोरोसेंट डाई का उपयोग करता है इन दोनों विधियों में आणविक जीव विज्ञान में भी अलग-अलग अनुप्रयोग हैं

संदर्भ:

1 Tajadini, मोहम्मद हसन, Mojtaba Panjehpour, और Shaghayehgh Haghjooy Javanmard। "चार एडेनोसिन रिसेप्टर उपप्रकारों के मात्रात्मक वास्तविक-समय पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन विश्लेषण में एसआईबीआर ग्रीन और ताकमान तरीकों की तुलना।"उन्नत बायोमेडिकल रिसर्च मेडकनो पब्लिकेशंस एंड मीडिया प्राइवेट लिमिटेड, 2014. वेब 13 मार्च 2017.

2 "वास्तविक समय पीसीआर बुनियादी सिद्धांतों "रियल टाइम पीसीआर, क्वांटिटेटिव (qPCR), प्राइमर और मास्टरएमिक्स: प्राइमर डिज़िग लिमिटेड, एन। पी।, एन घ। वेब। 13 मार्च 2017.

3 "एसआईबीआर ग्रीन और अन्य रियल-टाइम पीसीआर डाइज "बायोकैम्परे एन। पी।, 05 अप्रैल 2010. वेब 14 मार्च 2017

छवि सौजन्य:

1 "पीसीआर के साथ सीआईबीआर हरा" बाय-योनोरा 23: 9, 7 मार्च 2006 (यूटीसी) - यह एक ग्राफ बना है जो योनोर द्वारा पॉवर पॉइंट के साथ बनाया गया है, सीसी बाय-एसए 3. 0, // कॉमन्स विकिमीडिया। org / w / सूचकांक। php? curid = 619,528

2। "Taqman" उपयोगकर्ता द्वारा: Braindamaged - अपने काम (सार्वजनिक डोमेन) कॉमन्स के माध्यम से विकिमीडिया