एनजीएस और सेंगर सीक्वेंसिंग के बीच का अंतर | एनजीएस बनाम सेंगर सिक्वेंसिंग
मुख्य अंतर - एनजीएस बनाम सेंगर सीक्वेंसिंग
अगली पीढ़ी अनुक्रमण (एनजीएस) और सेंगर सीक्वेंसिंग समय के दौरान विकसित की गई दो प्रकार की न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमण तकनीक है। सेंगर सीक्वेंसिंग पद्धति का व्यापक रूप से कई सालों से इस्तेमाल किया गया था और इसके फायदे के कारण हाल ही में एनजीएस ने इसे बदल दिया था। एनजीएस और सेंगर सीक्वेंसिंग के बीच मुख्य अंतर यह है कि एनजीएस एक अनुक्रमण प्रणाली के माध्यम से तेजी से रास्ते में एक साथ लाखों अनुक्रमों के अनुक्रमण के सिद्धांत पर काम करता है जबकि सेंगर सीक्वेंसिंग डायडऑक्सीन्यूक्लियोटाइड के चयनात्मक निगमन के कारण चेन समाप्ति के प्रिंसिपल पर काम करता है। डीएनए प्रतिकृति के दौरान डीएनए पोलीमरेज़ एंजाइम और केशिका वैद्युतकणसंचलन द्वारा टुकड़ा अलग होने का परिणाम।
सामग्री
1। अवलोकन और महत्वपूर्ण अंतर
2 न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमण 3 क्या है एनजीएस 4 क्या है सेंन्जर सीक्वेंसिंग 5 क्या है साइड तुलना द्वारा साइड - एनजीएस बनाम सेंगर सीक्वेंसिंग 6 सारांश
न्यूक्लियोटाइड सीक्वेंसिंग क्या है?
आनुवंशिक जानकारी एक जीव के डीएनए या आरएनए के न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों में संग्रहित होती है।
किसी दिए गए टुकड़े (जीन, जीन के क्लस्टर, गुणसूत्र और पूर्ण जीनोम) में न्यूक्लियोटाइड (चार आधारों का उपयोग) के सही क्रम को निर्धारित करने की प्रक्रिया को न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमण
के रूप में जाना जाता है यह जीनोमिक अध्ययन, फोरेंसिक अध्ययन, विषाणु, जैविक व्यवस्थित, चिकित्सा निदान, जैव प्रौद्योगिकी और कई अन्य क्षेत्रों में जीनों की संरचना और कार्य का विश्लेषण करने में बहुत महत्वपूर्ण है। वैज्ञानिकों द्वारा विकसित विभिन्न प्रकार के अनुक्रमण पद्धतियां हैं उनमें से,
सेंगर अनुक्रमण
फ्रेडरिक सेंगर द्वारा 1 9 77 में विकसित किया गया था जिसका व्यापक रूप से इस्तेमाल किया गया और अगली पीढ़ी की सिक्वेंसिंग की जगह लंबे समय तक लोकप्रिय हुआ
चित्रा_1: एनजीएस अनुक्रमण में विकास
सेंगर अनुक्रमण क्या है?
सांकार सीक्वेंसिंग एक डीएनए टुकड़ा के सटीक न्यूक्लियोटाइड आदेश का निर्धारण करने के लिए 1 9 77 में फ्रेडरिक सेंगर और उनके सहयोगियों द्वारा विकसित एक अनुक्रमण पद्धति है। इसेश्रृंखला समाप्ति अनुक्रमण [999] या
डायडॉक्सी अनुक्रमण [999] के रूप में भी जाना जाता है। इस पद्धति का काम सिद्धांत डीएनएपी की प्रतिकृति के दौरान डीएनजीपीटीपी, डीडीसीटीपी, डीडीएटीपी और डीडीटीपी जैसे डीएनए पोलीमरेज़ जैसे डीडीएनटीपीज़ (डीडीएनटीपी) जैसे श्रृंखला समाप्त करने वाली डायडोऑक्सिनक्लियोटाइड्स के चयनात्मक निगमन द्वारा भूग्रस्त संश्लेषण की समाप्ति है। सामान्य न्यूक्लियोटाइड के पास 3 'ओएच समूह हैं जो कि निकटवर्ती न्यूक्लियोटाइड्स के बीच फॉस्फोडिएस्टर बंधन के गठन के लिए किनारा गठन को जारी रखने के लिए हैं। हालांकि, डीडीएनटीपी के इस 3 'ओएच ग्रुप की कमी है और न्यूक्लियोटाइड के बीच फास्फोडिस्टर बॉन्ड बनाने में असमर्थ हैं। इसलिए, श्रृंखला बढ़ाव समाप्त हो गया है।
इस पद्धति में, एकल-फंसे डीएनए अनुक्रमित किया जा सकता है,
इन विट्रो डीएनए संश्लेषण के लिए टेम्पलेट स्ट्रैंड के रूप में कार्य करता है। अन्य आवश्यकताएं ऑलिगोन्यूक्लियोटिड प्राइमर, डीओक्सीन्यूक्लियोटाइड प्रीर्सर्स और डीएनए पोलीमरेज़ एंजाइम हैं। जब लक्ष्य के टुकड़े की छिद्र समाप्त होती है, तो डीएनए प्रतिकृति के लिए प्राइमरों को आसानी से डिज़ाइन किया जा सकता है। चार अलग-अलग डीएनए संश्लेषण प्रतिक्रियाओं को चार अलग-अलग ट्यूबों में किया जाता है प्रत्येक ट्यूब में अलग-अलग आवश्यकताओं के साथ अलग डीडीएनटीपी हैं। विशेष न्यूक्लियोटाइड से, डीएनटीपी और डीडीएनटीपी का मिश्रण जोड़ दिया जाता है। इसी तरह, चार अलग-अलग प्रतिक्रियाओं को चार मिश्रणों में चार मिश्रणों में किया जाता है। प्रतिक्रियाओं के बाद, डीएनए टुकड़े का पता लगाने और अनुक्रम सूचना में टुकड़ा पैटर्न का रूपांतरण किया जाता है। डीएनए टुकड़े का परिणाम गर्मी विकृत हो गया है और जेल वैद्युतकणसंचलन द्वारा अलग किया गया है। यदि रेडियोधर्मी न्यूक्लियोटाइड का उपयोग किया जाता है, तो पॉलीएसिलामाइड जेल में बैंडिंग पैटर्न को आटोराडियोोग्राफी द्वारा देखा जा सकता है। जब यह विधि फ्लोरोसेंटली टैग किए गए डायडोओक्सिनक्लियोटाइड्स का उपयोग करती है, तो इसे जेल पढ़ा जा सकता है और फ्लोरोसेंट डिटेक्टर द्वारा पता लगाए जाने वाले लेजर के बीम के माध्यम से इसे पार किया जा सकता है। जब कोई अनुक्रम आंख से पढ़ा जाता है और एक कंप्यूटर में मैन्युअल रूप से प्रवेश करता है तो ऐसी त्रुटियों से बचने के लिए, यह विधि कंप्यूटर के साथ मिलकर स्वचालित सीक्वेंसर के इस्तेमाल में विकसित होती है। यह मानव जीनोम परियोजना से डीएनए के अनुक्रम के लिए इस्तेमाल की जाने वाली विधि है। यह विधि अब भी उन्नत संशोधनों के साथ प्रयोग में है क्योंकि यह एक महँगा और धीमी प्रक्रिया होने के बावजूद सटीक अनुक्रम जानकारी देता है। चित्रा 1 चित्रा: सेंजर सिक्वेंसिंग एनजीएस और सेंगर सीक्वेंसिंग के बीच अंतर क्या है? - तालिका से पहले अंतर आलेख ->
एनजीएस बनाम सेंगर अनुक्रमण अगली पीढ़ी अनुक्रमण (एनजीएस) आधुनिक उच्च-थ्रुपुट अनुक्रमण प्रक्रियाओं का संदर्भ देते हैं।यह कई विभिन्न आधुनिक अनुक्रमण तकनीकों का वर्णन करता है सेंगर सीक्वेंसिंग एक डीएनए टुकड़ा के सटीक न्यूक्लियोटाइड आदेश को निर्धारित करने के लिए फ्रेडरिक सेंगर द्वारा विकसित एक अनुक्रमण पद्धति है।
लागत प्रभावशीलता
एनजीएस एक सस्ता प्रक्रिया है क्योंकि यह समय, मानव शक्ति और रसायनों को कम करता है
यह एक महंगा प्रक्रिया है क्योंकि इसमें समय, मनुष्य की शक्ति और अधिक रसायनों की आवश्यकता होती है।
स्पीड
यह बहुत ही तेज है क्योंकि कई किस्में दोनों का पता लगाने और सिग्नल का पता लगाने समानांतर हो रहा है। |
|
| यह समय-समय लेने वाला है क्योंकि रासायनिक पहचान और संकेत पहचान दो अलग-अलग प्रक्रियाओं के रूप में होता है और केवल किनारा पर एक समय में पढ़ा जा सकता है। | विश्वसनीयता |
| एनजीएस विश्वसनीय है | |
| सेंगर अनुक्रमण कम विश्वसनीय है | नमूना आकार |
| एनजीएस को कम मात्रा में डीएनए की आवश्यकता होती है। | |
| इस पद्धति को बड़ी मात्रा में टेम्पलेट डीएनए की आवश्यकता है। | अनुक्रमित टुकड़े के आधार पर डीएनए कुर्सियां |
| प्रति अनुक्रमित टुकड़े डीएनए आधार की संख्या सेंगर पद्धति से कम है | |
| उत्पन्न सीजेन्स एनजीएस अनुक्रमों की तुलना में लंबा है। | सारांश - एनजीएस बनाम सैंगेर सेक्शनिंग |
| एनजीएस और सेंगर सीक्वेंसिंग न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमण तकनीकों का व्यापक रूप से आणविक जीवविज्ञान में प्रयोग किया जाता है। सेंगर अनुक्रमण एक प्रारंभिक अनुक्रमण पद्धति है जिसे एनजीएस द्वारा प्रतिस्थापित किया गया था। एनजीएस और सेंगर सीक्वेंसिंग के बीच मुख्य अंतर यह है कि एनजीएस सेंगर अनुक्रमण के मुकाबले एक उच्च गति, अधिक सटीक और लागत प्रभावी प्रक्रिया है। दोनों तकनीकों ने जेनेटिक्स और जैव प्रौद्योगिकी में प्रमुख प्रकोपों का निर्माण किया। | |
| संदर्भ: | 1 नोओरसियन, मिनौ "यूकेरियोटिक सूक्ष्मजीवों के लिए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण तकनीकों: जैविक समस्याओं के लिए अनुक्रमण-आधारित समाधान " यूकेरियोटिक सेल। माइक्रोबायोलॉजी, सितम्बर 2010 के लिए अमेरिकन सोसायटी। वेब 18 फरवरी 2017 |
| 2 सेंगर, एफ, एस। निक्लिकेन, और ए आर। कॉलसन। "श्रृंखला समाप्त करने वाले अवरोधक के साथ डीएनए अनुक्रमण "नेशनल एकेडमी ऑफ साइंसेज की कार्यवाही 74. 12 (1 9 77): 5463-467 वेब। | |
| 3। लियू, लिन, यिनहु ली, सिलीआंग ली, नी हू, यिमिन हे, रे पोंग, दन्नी लिन, लिहुआ लू, और मैगी लॉ। "अगली पीढ़ी के अनुक्रमण प्रणाली की तुलना "बायोमेडिसिन और जैव प्रौद्योगिकी 2012 के जर्नल (2012): 1-11 वेब। | छवि सौजन्य: |
"एसेंजर-सिकेंजिंग" एस्टेवेज़ द्वारा - स्वयं काम (सीसी बाय-एसए 3. 0) कॉमन्स विकिमीडिया के माध्यम से
"अगली पीढ़ी के अनुक्रमण में विकास" नेदरब्रैग, लेक्स (2012) - (सीसी बाय 3. 0) कॉमन्स के माध्यम से विकिमीडिया
